Urodzony w Krakowie studiował we Wiedniu filozofię, architekturę i agronomię. Pasję do malarstwa i sztuki zaszczepił w nim ojciec, Jacek Malczewski, profesor krakowskiej Akademii Sztuk Pięknych. W 1917, dwa lata po ukończeniu studiów, Malczewski przeprowadził się do Zakopanego gdzie stał się członkiem artystyczno-intelektualnej elity. Dołączył do Towarzystwa Sztuki Podhalańskiej by wspierać idee zakorzenienia się polskiej sztuki w lokalnym folklorze. Od 1925 roku tworzył projekty oprawy scenograficznej dla Teatru Formistycznego. W 1930, podróżował do Francji gdzie powrócił po wybuchu II wojny światowej przedzierając się przez Słowację, Węgry i Włochy. W 1940 uciekł do Brazylii przez Hiszpanie i Portugalie, po dwóch latach malowania widoków Rio de Janeiro i Kurytyby przeniósł się do Stanów Zjednoczonych, a następnie osiadł w Montrealu. Obficie zwiedzał krajobrazy Kanady i Stanów Zjednoczonych w poszukiwaniu inspiracji do malowania. W 1959 roku odwiedził Polskę ale pomimo tęsknoty za ojczyzną, nie zdecydował się powrócić na stałe. Przeżyty w 1957 udar mózgu uniemożliwił Malczewskiemu dalsze malowanie farbą olejną ale uprawiał dalej akwarele. W 1964 odbyła się jego ostatnia wystawa, a rok później zmarł w Montrealu.